真菌检查的方法主要有直接涂片、墨汁涂片、涂片或组织切片染色和培养检查。
1、直接涂片：为最简单而重要的诊断方法。取标本置玻片上，加一滴10%：KOH溶液，盖上盖玻片，在酒精灯火焰上稍加热溶解角质后，轻轻加压盖玻片使标本透明即可镜检。可用于检查有无菌丝或孢子，但不能确定菌种。
2、墨汁涂片：用于检查隐球菌及其他有荚膜的孢子。取一小滴墨汁与标本(如脑脊液)混合，盖上盖玻片后直接镜检。
3、涂片或组织切片染色：染色可更好地显示真菌形态和结构。革兰染色适用于白念珠菌、孢子丝菌等；瑞氏染色适用于组织胞浆菌；组织切片PAS染色，可将多数真菌染成红色。
4、培养检查：可提高真菌检出率，并能确定菌种。标本接种于葡萄糖蛋白胨琼脂培养基上，置室温或37℃培养1-3周，必要时可行玻片小培养协助鉴定。菌种鉴定常根据菌落的形态及显微镜下形态判断，对某些真菌，有时尚需配合其他鉴别培养基、生化反应或分子生物学方法确定菌种。
参考资料：[1]张学军.皮肤性病学.第8版[M].北京.人民卫生出版社.2013.