通常肥皂的杀菌效果要优于香皂，但是需避免仅依靠肥皂或者香皂来杀灭皮肤上的细菌，香皂和肥皂的区别主要在于成分略有不同，作用也不同。
1、成分不同：肥皂是脂肪酸金属盐的总称，其主要成分有硬脂酸钠、合成色素、防腐剂、硬化剂等，香皂是肥皂的一种，其与肥皂的不同之处在于香皂中可能会加入香精，以及对肌肤有益的物质，如橄榄油、甘油等。
2、作用不同：肥皂在生活中主要用于去污、洗涤，如洗衣服、洗手等，对于比较多的油垢、油污等，使用肥皂能够起到较好的清洁作用。由于肥皂属于碱性物质，因此可以破坏细菌渗透压，可以起到辅助杀菌的作用。香皂主要功能是用于皮肤的清洁，其碱性比肥皂要弱，因此杀菌作用也相对较弱。
肥皂与香皂主要用于清洁，对于皮肤出现的细菌感染治疗效果较差，存在皮肤感染情况时，建议遵医嘱用碘伏、医用酒精等杀灭皮肤上的细菌。