支气管功能需与气管协同完成，主要包括呼吸调节、清洁、防御性咳嗽反射、免疫等。
1、呼吸调节功能
气管、支气管是吸入氧气，呼出二氧化碳，进行气体交换的主要通道，有调节呼吸的作用。吸气时，气管、支气管扩张，可刺激位于气管、支气管内平滑肌感受器，兴奋由迷走神经纤维传至延髓呼吸中枢，抑制吸气中枢，使吸气转为呼气。呼气时，气管、支气管缩小，对感受器的刺激减弱，减少了对吸气中枢的抑制，于是吸气中枢又逐渐处于兴奋状态，开始了又一次的呼吸周期。吸气时，由于气管、支气管管腔增宽、胸廓扩张与膈肌下降，呼吸道内压力低于外界压力，有利于气体吸入。反之，呼气时，呼吸道内压力高于外界，可将气体排出。
2、清洁功能
呼吸道的清洁作用，有赖于气管、支气管内黏液与纤毛的协同作用。呼吸道黏液主要来源于气管、支气管黏膜中的黏液腺。正常情况下，黏液借纤毛的运动排出，仅少量湿润吸入的空气。黏液可湿润呼吸道黏膜，并维持黏膜层纤毛的正常运动，对细菌、机械性刺激与化学性损伤具有表面保护作用。
3、防御性咳嗽反射
在气管、支气管内壁黏膜下具有丰富的传入神经末梢，主要来自迷走神经。冷、热等机械性刺激，烟尘、刺激性气体等化学性刺激，均能刺激神经末梢而引起咳嗽反射，具有维持呼吸通畅的作用。
4、免疫功能
在呼吸道分泌物中含有与抗感染有关的免疫球蛋白，如lgA、lgG、IgM与lgE等。呼吸道分泌物中的免疫球蛋白，一般以分泌性IgA为主，具有抑制细菌生长及中和毒素的作用，是呼吸道抗感染的主要免疫球蛋白。呼吸道分泌物中尚含有溶菌酶与补体，与分泌性IgA共同起溶菌作用。