malt淋巴瘤需要与胃癌、胃溃疡、滤泡性淋巴瘤等疾病鉴别。
1、胃癌：胃癌是一种发生于胃部组织的恶性癌变，其也会对胃部间质组织造成浸润性破坏，并与胃malt淋巴瘤病症存在一定相似性。一般需要通过组织活检的形式，对肿瘤类型以及性质进行鉴别诊断。
2、胃溃疡：胃溃疡也常与幽门螺旋杆菌感染存在关联性，但是胃溃疡进行上消化道内窥镜检查过程中，只观察到胃壁溃疡的迹象，并无赘生性组织的存在。
2、弥漫性大B细胞淋巴瘤：弥漫性大B细胞淋巴瘤是一种较为常见的非霍奇金淋巴瘤，可发生于体内任何系统组织当中。通常需要对病变区域进行活体检测才能与malt淋巴瘤进行区别。
3、滤泡性淋巴瘤：滤泡性淋巴瘤约占非霍奇金淋巴瘤的20%，早期患者表现为无痛性淋巴结肿大，但是随着病情发展，也会对周围正常组织造成侵犯。临床上需要通过对病变组织进行病理学分析，才能进行明确诊断。