水疱型足癣需清除致病菌，缓解症状，防止复发。以抗真菌治疗为主，可外用和口服联用，治疗继发感染。常见药物有硝酸咪康唑乳膏、咪康唑、特比萘芬等。
1、局部治疗：临床常用的外用抗真菌药物如下，水疱型足癣应选择无刺激性的溶液或乳膏剂型：
（1）咪唑类抗真菌药物：包括克霉唑、益康唑、咪康唑、酮康唑、联苯苄唑、异康唑、舍他康唑、奥昔康唑及卢立康唑等。根据不同的药物，可外用每日1-2次，一般疗程需要4周。
（2）丙烯胺类抗真菌药物：包括萘替芬、特比萘芬和布替萘芬。由于该类药物在体外对皮肤癣菌的抗菌活性较强，每日1-2次外用，一般疗程2-4周即可获得良好的疗效。
（3）其他抗真菌药物：包括阿莫罗芬、环吡酮胺、利拉萘酯等，外用每日1-2次，一般疗程需要4周。
2、系统治疗：若局部治疗疗效欠佳、反复发作及伴有某些系统性疾病（如糖尿病、艾滋病等）导致免疫功能低下的患者，可以联用口服抗真菌药物，如伊曲康唑、特比萘芬等。
3、其他治疗：足癣继发细菌感染时应先处理继发感染，必要时全身使用抗生素。