引起叶酸偏低的因素包括疾病因素和非疾病因素。疾病因素主要是消化系统疾病，非疾病因素主要与药物因素以及特定人群有关。
一、疾病因素
消化系统疾病：营养不良、吸收不良综合征、胃大部切除术等吸收功能障碍，可导致摄入食物叶酸量减少而引起叶酸偏低。
二、非疾病因素
1、药物因素：通过一碳通路进行代谢的癌症治疗药物，如甲氨蝶呤和 5′-氟尿嘧啶，可能会导致功能性叶酸缺乏；口服避孕药因含有雌激素能降低结合酶的活性而阻碍叶酸吸收，使血液叶酸水平下降；抗惊厥药如苯巴比妥、苯妥英钠等可抑制叶酸的吸收；阿司匹林可降低叶酸与血浆蛋白质的结合能力, 使游离型叶酸增多贮存型叶酸减少而使叶酸排出量增加；还有一些抗叶酸药物如甲氨蝶吟、乙胺嘧啶、等可以直接导致叶酸偏低。
2、特定人群：老人及进食量少的人群可能因为饮食摄入不足导致叶酸水平偏低；妊娠妇女对叶酸需求量增加，因此未及时补充叶酸的人群可能出现叶酸偏低。