医院病理科主要是进行病理诊断的工作，主要包括活体组织检查、细胞学检查、尸检、免疫荧光检查等。
1、活体组织检查：是病理科的主要工作，任何从患者身上采取的组织标本，如手术标本、组织穿刺标本、胃肠镜标本等，都必须经病理组织学检查。以明确标本具体的性质，辅助诊断疾病，有助于开展下一步的诊疗工作；
2、细胞学检查：主要包括痰涂片、宫颈刮片、胸腹水等，可以辅助明确诊断，并且可以协助肿瘤的普查；
3、尸检：病理科进行尸检，有助于查明死亡原因，经过病理解剖的尸检结果，具有客观、可靠的价值，尸检是医疗质量检查的金标准；
4、免疫荧光检查：主要用于皮肤病或肾穿刺活检的诊断，运用冰冻切片以及荧光抗体染色，有助于诊断肾病，对肾病的预后也有一定的作用。
此外，还包括电镜、免疫组化、分子技术等各种辅助病理检查。临床上诊断疾病，尤其是肿瘤，除了要依赖于病理检查结果，还需要结合肿瘤标志物、CT、彩超、核磁等检查综合判断。