杵状指可以由非因素及疾病因素导致，疾病因素包括心血管系统疾病、呼吸系统疾病、消化系统疾病、营养障碍性疾病及慢性高原病等其他类型疾病，非疾病因素包括遗传因素和中毒。
一、疾病因素
1、呼吸系统疾病
呼吸系统疾病导致的杵状指占到全部杵状指的75%~80%，包括转移性肺癌、非霍奇金病、纵隔肿瘤、胸膜间皮瘤、支气管扩张、肺脓肿、肺囊性纤维化、弥漫性肺间质纤维化、尘肺、肺动-静脉畸形、开放性肺结核等疾病。
2、心血管系统疾病
心血管系统疾病导致的杵状指占到全部杵状指的10%~15%，包括先天性发绀型心脏病、亚急性细菌性心内膜炎、主动脉弓动脉瘤、无名动脉瘤、锁骨下动脉瘤、腹主动脉修补术后感染或动脉导管未闭伴血液反流等疾病。
3、消化系统疾病
消化系统疾病导致的杵状指占到全部杵状指的5%~10%，包括溃疡性结肠炎、克罗恩病、肝硬化、食管癌、结肠癌等疾病。
4、其他
特发性肥大性骨关节病、全身性淀粉样变性、慢性败血症、脊髓空洞症、慢性高山病、甲状腺功能亢进症、甲状腺切除后的粘液性水肿、左心房粘液瘤等疾病的患者都有可能出现杵状指改变。
二、非疾病因素
1、遗传因素
有文献报道遗传性杵状呈显性遗传，家族聚集性病例较为少见，多数患者在10岁左右出现手指末端膨大，不影响正常的生活、工作及学习。
2、中毒
中毒导致的杵状指的发生多为慢性中毒，和患者生活的环境息息相关，可以引起杵状指的中毒物质如砷、磷等。