怀孕11周的最佳流产方式是先采取药物流产，待孕囊排出后再手术清宫，也可以进行直接钳刮。
药物流产指的是通过药物而非手术的方法终止妊娠。常用药物为米非司酮加前列腺素。相对无创、便捷，是目前临床上普遍应用的一种流产方式。
但药物流产在胎囊排出后仍需要逐渐排出蜕膜组织，有药流失败和流产不全、大量出血的可能，因此应在具备抢救条件，如急诊刮宫、吸氧、输液、输血的区县级以上医疗服务机构进行，切忌私自药流。如果出现胎盘、胎膜残留，此时再行手术清宫。
清宫术是通过手术的方式将子宫内的异常组织或子宫内膜、胚胎等清除出子宫的一种治疗性操作。主要适用于药流不全、异常子宫出血、葡萄胎、不全流产、胚胎停育、瘢痕妊娠、产后出血、产后胎盘残留等，是临床上妇科常用的一种操作，在无痛麻醉下进行可以减轻患者疼痛。