出现脉搏短绌时，临床常用的治疗药物包括抗凝药物治疗、转复并维持窦性心律药物治疗、控制心室率药物治疗，具体如下：
1、抗凝治疗：常用药物华法林及新型口服口服抗凝剂，由于房颤及脉搏短绌的血流动力学状态，很容易导致患者在心房内形成血栓，因此要进行抗凝处理。抗凝前要首先评估患者的血栓栓塞和出血风险，由专业医生决定是否需要抗凝治疗并选择药物的使用类型及剂量。不适合长期抗凝治疗或长期规范抗凝治疗基础上仍发生卒中或栓塞事件，出血风险评估评分≥3分的病人可以考虑行经皮左心耳封堵术；
2、转复并维持窦性心律：目前临床上最常使用的药物为胺碘酮为代表的抗心律失常药，在使用药物时要以小剂量长期维持治疗，可以有效防止复发。对于经药物治疗无效的患者，可以采用电复律、导管消融，外科迷宫手术等治疗；
3、控制心室率：控制心室率的药物包括β受体阻滞剂、地高辛、非二氢吡啶类钙通道阻滞剂等药物。