相对而言，化疗的伤害比放疗更大，因为化疗是使用化疗药物，通过口服或静脉注射等方式对肿瘤细胞进行杀灭，以全身治疗为主，药物进入体内后分布于全身，不仅杀死肿瘤细胞，对于正常的细胞也有一定的杀伤作用，因此副作用以全身反应为主。
而放疗多是作用于癌症的原发灶或转移灶，以局部治疗为主，对身体的伤害也以局部为主。如头颈部放疗可能出现咽痛、口干，胸部放疗可能出现肺部改变，但也有较小可能出现乏力、食欲不振等全身反应。
化疗比较常见的损害包括肝损伤、骨髓抑制、消化道反应、皮肤过敏等，还包括脱发、浮肿、神经异常等，比放疗造成的伤害更明显，而且可多种副作用同时出现，在临床上患者对化疗的耐受程度也更低，因此化疗比放疗的伤害更大。