幽门螺旋杆菌临床上通常是指幽门螺杆菌，早上喝水是否可以做幽门螺杆菌检查需要根据喝水量来进行评估，如果只是少量喝水，通常可以做幽门螺杆菌的检查。但是如果是大量喝水，则不建议做幽门螺杆菌的检查，可能会影响检查结果。
1、可以：幽门螺杆菌检查是根据幽门螺杆菌产生的尿素酶分解尿素标记物，形成氨气和二氧化碳排出体外，通过测定呼出气体中的二氧化碳量，来判断是否存在此感染。通常需要禁止饮食8个小时以上，在空腹的状态下进行检查。如果早上少量喝水，对幽门螺杆菌的检测没有太大影响，且此检查本身也需要少量喝水将检查用的尿素标记物的药物吞下，以便于检查；
2、不可以：如果早上大量喝水，通常会导致胃酸稀释，降低胃黏膜表面的尿素酶浓度，影响尿素酶对于尿素标记物的分解，从而会导致幽门螺杆菌检查结果误差性增大，不能有效诊断出是否存在幽门螺杆菌感染。
如果检查结果超过了正常范围值，考虑存在幽门螺杆菌感染的可能性较大，需要遵医嘱服用奥美拉唑镁肠溶片、阿莫西林胶囊、甲硝唑片、胶体果胶铋胶囊等药物进行治疗。