病毒性肝炎的治疗应根据不同病原、不同临床类型及组织学损害进行区别。各型肝炎的治疗原则均以充分休息、合理饮食，辅以适当药物对照治疗，避免饮酒、过度劳累和肝损害药物。
一、药物治疗
常见药物：拉米夫定、干扰素、泛昔洛韦、水飞蓟宾、甘草酸二铵
1、干扰素：可抑制乙肝病毒的复制。丙型肝炎选用干扰素，可与利巴韦林联合应用。部分患者可能出现发热、头痛、白细胞数量下降、转氨酶增高等不良反应。
2、拉米夫定：是一种合成的二脱氧胞嘧啶核甘类药物，具有抗HBV的作用。不良反应为呼吸道感染、头痛、腹部不适和疼痛、恶心、呕吐和腹泻等。
3、泛昔洛韦：是一种鸟苷类药物，它的半衰期长，在细胞内浓度高，可以抑制HBV-DNA的复制。常见不良反应是头痛和恶心。
4、促肝细胞生长素：促进肝细胞再生，对肝细胞损伤有保护作用，并能调节机体免疫功能和抗纤维化作用。部分患者用药期间可见皮疹和低热，停药后症状即可消失。
5、水飞蓟宾：有保护和稳定肝细胞膜作用。个别患者用药期间有恶心、头晕等症状。
6、甘草酸二铵：具有较强的抗炎，保护细胞膜及改善肝功能的作用，适用于伴有谷丙转氨酶升高的慢性迁延性肝炎及慢性活动性肝炎。
7、腺苷蛋氨酸：补充外源性的腺苷蛋氨酸有促进黄疸消退和肝功能恢复的作用。部分患者用药后可能感到胃灼热和上腹痛。
二、手术治疗
肝移植：是各型肝炎终末期患者的主要治疗手段，目前该技术基本成熟。
三、其他治疗
人工肝支持系统治疗：各型肝炎进展到肝衰竭的早、中期患者，或晚期等待肝移植供体者、肝移植术后排异者、移植肝无功能期者可进行人工肝支持系统治疗，清除患者血中毒性物质、补充生物活性物质，减缓疾病发展。