小肠血管瘤需要与以下疾病鉴别：
1、缺铁性贫血：患者面色苍白、无力、易困乏、头晕眼花，吞咽时困难或出现梗阻等现象。小肠血管瘤也有相应症状，但消化道出血是主要表现，长期的出血会导致缺铁性贫血，按缺铁性贫血治疗一段时间后贫血症状会反复出现，可以此鉴别。
2、十二指肠溃疡：亦可出现腹痛，消化道出血，等症状，这些都是小肠血管瘤的主要症状。但需要借助X线检查，动脉造影，十二指肠镜检加组织学检查与十二指肠肿瘤鉴别，必要时需手术探查以明确诊断。
3、肠结核：肠结核有腹痛，腹泻或便秘，肿块等表现，易被误认为小肠血管瘤，但肠结核伴有发热，盗汗等结核毒血症的表现，且常伴有肠外结核，可通过胃肠X线钡剂检查显示回盲部有激惹，充盈缺损或狭窄等征象，纤维结肠镜检查病变部位有溃疡，僵硬，狭窄等表现，活检可发现典型结核病变-干酪样肉芽肿。使用抗结核治疗常有效，可与小肠血管瘤鉴别。