胰腺脓肿引流术分为清创引流和穿刺引流两种，其中传统的穿刺引流很难将坏死物和脓液引流出来，且要放置多根导管，成功率较低，目前逐渐被内镜下穿刺引流所代替。以下介绍的是胰腺脓肿清创引流术和超声内镜引导下胰腺脓肿穿刺引流术主要手术步骤。
一、胰腺脓肿清创引流术
1.选择正中或双侧胁缘下切口，打开胃结肠韧带，进人小网膜囊到达胰。脓肿的开窗必须足够大，所有的坏死组织都必须彻底清除。清创的时候必须用手指或镊子小心地钝性分离，广泛的清洗脓腔有利于充分去除坏死组织。
2.处理装腔：处理方法可以选择近距离持续的局部冲洗，使用二号或者更大的双硅胶管插人到小网膜囊和感染区域，冲洗可以减少创伤和持续排出坏死组织。还可以选择拉链技术，主要用于脓肿弥散到周围组织并导致组织坏死的情况，特别是坏死突破结肠曲的部分。还可以在所有脓肿区域放置一组软硅胶管闭式吸引引流和填有纱布的Penrose引流管，放好引流管后关腹。当病情好转，局部愈合时逐渐退出引流管，从而脓腔塌陷闭合。
二、超声内镜引导下胰腺脓肿穿刺引流术
1.插入超声内镜，显示脓肿的位置，选择合适的穿刺点，用彩色多普勒超声显示邻近的血管结构。
2.将穿刺针缩入外鞘内，插入超声内镜管道，然后伸出针尖，在超声影像下识别针尖的位置。
3.在超声影像的指导下将针刺入脓肿腔内，当有明显落空感时，表明穿刺针进入脓肿。
4.抽取少量囊液进行细胞学及生化检查。
5.在内镜及X线的监视下，将导丝由针腔置入，将导丝在脓肿内盘曲2~3周。拔出穿刺针，沿导丝将扩张探条插入，扩张组织针道至与引流管外径相当，经胃做脓肿引流。若脓肿比较厚，探条往往很难插入，可采用管型脓肿切开刀扩大针道。
6.在导丝引导下置入内引流管，退出内镜，将引流管经鼻腔引出、固定并连接吸引容器。