三岁宝宝腹痛比较常见，多数是因为消化道系统疾病所引起，由于宝宝自述能力较弱，其父母在发现患儿出现异常情况时，应及时就医，寻找引起腹痛的原因，以免造成严重后果，威胁生命。
常见的病因有内科性腹痛、外科性腹痛等。
小儿内科性腹痛，一般不需要手术治疗，外科性腹痛往往需要紧急手术治疗，内科性腹痛包括腹内疾病，如病毒性肝炎、胰腺炎、腹膜炎、肝脓肿、膈下脓肿、尿路感染、细菌性痢疾、肠道痉挛、肠及胆道蛔虫等。此外，系膜淋巴结炎、急性胃肠炎、胃十二指肠溃疡、便秘等，均可以引起腹痛。
腹外疾病引起的疼痛是神经方面性疾病，代谢性的疾病，还有呼吸系统、心血管系统等疾病，也可以引起腹痛，尤其要注意带状疱疹和铅中毒等。外科性的腹痛，包括急性阑尾炎、胃十二指肠消化道溃疡合并穿孔、肠系膜血栓、肠套叠肠扭转、肠梗阻等疾病，均可引起腹痛。
还有些非特异性腹痛，患病率大概在5%-10%，呈间歇性发作，持续一段时间后，疼痛可以自行缓解，疼痛一般不剧烈，可伴有恶心、呕吐等症状，疼痛部位不定，以上腹痛和脐周痛多见。