脸上凸起小肉球，如果是不同因素导致，消除方法不同，一般考虑以下几种：
1、皮脂腺囊肿：如果是比较小的囊肿，可以遵医嘱口服罗红霉素胶囊，同时可以应用复方黄柏洗剂进行局部冷湿敷，然后甲硝唑凝胶和糠酸莫米松乳膏混合外用。经过上述治疗后如果囊肿未见缓解，建议患者到皮肤科进行微创囊肿刮除术。在治疗期间不要用手去挤压囊肿，避免感染。
2、寻常疣：建议遵医嘱选择维A酸软膏外涂，同时还建议患者到皮肤科进行液氮冷冻治疗，或者是二氧化碳激光治疗。经过上述治疗后，如果患者仍未见缓解，还可以遵医嘱加服口服药的治疗，如转移因子口服溶液。在治疗期间需要清淡饮食，禁忌用手挤压寻常疣。
针对脸上出现凸起的小肉球的情况，建议患者到正规医院在专业的皮肤科医生指导下进行治疗。