急性肠胃炎为急性胃肠炎，患者在患病期间应该多休息，最好卧床。饮食方面以清淡饮食为主，缓解消化道、胃肠道的压力。日常的饮食要注意干净卫生，防止交叉感染，切忌勿食刺激性食物。
患者在临床治疗时可以使用复方磺胺甲噁唑片、黄连素等抗生素控制细菌感染。如果是胃肠道黏膜损伤，可以给予蒙脱石散等保护胃肠黏膜。对于因有害细菌导致的腹泻，可以使用酪酸梭菌二联活菌胶囊、枫蓼肠胃康合剂等，调整肠道菌群失调。
急性胃肠炎儿童患者在使用抗生素时，禁用庆大霉素、诺氟沙星等。病情比较严重，电解质紊乱和脱水的患者，可采用静脉输液治疗或者口服补液治疗，这两种疗法效果一样，可以调节轻度至中度脱水患者的水分和电解质平衡。
对于重度患者，可能伴有钠、钾、氯电解质紊乱，此时需要适量补充5%碳酸氢钠，既可以补充体内水分，又可以补充葡萄糖和电解质。如果出现恶心、呕吐等症状，可以给予胃复安止吐。如果出现腹痛症状，可以使用解痉药，如山莨菪碱注射液进行肌肉注射，缓解疼痛症状。