十二指肠溃疡一旦确诊后，要采取正确有效的治疗方法。
1、药物治疗：制酸药物与胃内盐酸作用，形成盐和水，使胃酸降低种类繁多，包括碳酸氢钠、碳酸钙、氢氧化铝等，抑酸药物H2受体拮抗剂，包括雷尼替丁、西咪替丁等。
PPI包括奥美拉唑、兰索拉唑、雷贝拉唑等。胃黏膜保护剂可分为外源性覆盖型胃黏膜保护剂，和内源修复性胃黏膜，具体药物包括胶体果胶铋、硫糖铝、铝碳酸镁、瑞巴派特、米索前列醇片等。
硫糖铝是硫酸化蔗糖和铝盐组成的复杂化合物，当暴露有胃酸时，硫酸盐通过静电与损伤组织的带电蛋白结合，硫糖铝和H2受体拮抗剂，在治疗十二指肠溃疡时同样有效。
米索前列醇片，被用于治疗非甾体抗炎药物引起的消化性溃疡，可以加强黏膜的防御屏障，同时可以抑制胃酸分泌。
2、内镜治疗：主要用于消化性溃疡出血，当出现内镜下止血失败、复发出血、严重穿孔、幽门和十二指肠梗阻时，应及时外科手术治疗。
3、幽门螺杆菌相关溃疡的治疗：根除幽门螺杆菌不仅有助于治疗消化性溃疡，也对溃疡复发和并发症，起预防作用。
80%-90%十二指肠溃疡患者，伴有幽门螺杆菌感染，因此消化性溃疡患者，有必要检查是否伴有，幽门 螺杆菌感染。