儿童癫痫治疗以药物治疗为主，药物选择需要依据患者发作类型进行，卡马西平及奥卡西平，以及左乙拉西坦和拉莫三嗪，多用于局灶性癫痫发作的一线治疗。拉莫三嗪及丙戊酸钠，用于原发性全身性癫痫的一线治疗。
乙琥胺是失神性癫痫儿童的首选治疗药物。左乙拉西坦及托吡酯对全身性癫痫效果较好，此外还对不同类型的癫痫发作具有广谱抗癫痫作用。氨己烯酸、甲泼尼龙是儿童痉挛症治疗的首选药物。
难治性癫痫儿童可以选择手术治疗，立体定向放射治疗适合子痫灶位置较深，或位于功能区的癫痫儿童。中医治疗、电刺激治疗都具有一定辅助治疗功效。
还可以选择心理治疗和饮食疗法。饮食上选择高脂、低碳水化合物，一定量蛋白质食物，营养丰富均衡，不要给癫痫儿童喝可乐，避免兴奋神经。儿童癫痫的治疗需要综合治疗，以药物和手术治疗为主，同时辅助心理疗法、饮食疗法和中医疗法。