引起泌尿道感染，最常见的细菌是大肠杆菌、链球菌、绿脓杆菌、葡萄球菌、淋球菌等。除了细菌之外，还有可能是支原体、衣原体、滴虫、真菌等感染。另外还有特殊的致病微生物，比如结核杆菌。
对于患有泌尿道感染的患者，需要及时地做尿常规检查，尿液的培养以及药敏检查，来明确引起尿道感染的致病微生物以及敏感药物，根据检查结果来进行针对性的治疗。
如果是细菌感染引起的通常选用喹诺酮类抗生素，或者是头孢类抗生素，用药1周左右多数患者可以痊愈。
如果是支原体、衣原体感染，通常选用大环内酯类的抗生素。如果是滴虫感染引起的，则建议选用甲硝唑类的药物。如果是结核杆菌引起的，则需要使用抗结核的药物，比如异烟肼、利福平等。
无论哪种致病微生物引起的泌尿道感染，治疗期间都需要注意多喝水、勤排尿，加强个人的外生殖器卫生护理，而且治疗期间要禁止性生活。