长期不吃早餐容易对消化系统造成损害。如果不吃早餐前一天吃进去的食物早已经排空，胃长时间处于饥饿状态，胃酸以及胃内的消化酶会损伤胃黏膜，久而久之细胞分泌黏液的正常功能就会遭到破坏，很容易造成胃溃疡、胃炎等消化系统疾病。
有时因为早餐不吃，到午餐时会过度饥饿而大量进食，又会造成消化系统的负担，另外不吃早餐还会对人的大脑造成伤害，使人反应迟钝，对于部分腺体也会造成损伤导致慢性病，对于胆囊也会造成影响而出现胆结石，还有可能会造成胃结肠反射作用失调，产生便秘。
如果早餐的质量不佳，甚至不吃早餐，人体只能利用体内储存的蛋白质，长此以往会导致皮肤干燥、起皱，还会造成贫血、营养缺乏症等疾病，从而加速人体的衰老。所以早饭要吃好并且营养要丰富，要包括水果、蔬菜，以及蛋白质等多种营养成分。