慢性鼻窦炎的治疗，从大体上分为药物治疗以及手术治疗。具体的治疗方案，还需要结合病人的具体症状，以及辅助检查制定个体化的治疗方案。
慢性鼻窦炎的主要临床症状，有反复的鼻塞、流脓鼻涕、头昏、头痛、嗅觉下降等。对于慢性鼻窦炎患者，建议完善鼻内镜、鼻窦CT等相关检查，进一步评估鼻窦的严重程度，以及病变范围。治疗方面可以分为药物保守治疗，以及手术治疗，常规的药物可使用鼻用糖皮质激素、大环内酯类的抗生素，促进黏液运动的促排剂，以及治疗鼻炎的中成药物，鼻腔灌洗等。
如果患者病程时间长，症状严重，同时合并有鼻息肉，或者鼻腔存在结构异常，如鼻中隔偏曲、中鼻甲反向等情况，经过药物治疗无法有效地治愈，则需要手术治疗，行功能性鼻内镜手术才能够根治。