尿路感染的患者做体检，除了一般体检以外应当进行全面的泌尿系统体检。
男性患者需要进行外生殖器和直肠指诊的检查，急性膀胱炎患者可有耻骨上区压痛、发热、心动过速、肋脊角压痛，对肾盂肾炎的诊断特异性高，盆腔和直肠检查对鉴别是否同时存在合并疾病有意义。女性慢性、复发性、难治性尿路感染必须进行盆腔检查。
当患者存在不明原因的发热，严重的低血压，感染中毒性休克时，要考虑存在肾盂肾炎的可能。
实验室检查最常规的是尿常规检查，其次是尿培养检查，通过治疗前的中段尿培养，是诊断尿路感染的最可靠的指标。
感染标记物中有降钙素原和白细胞介素-6、白细胞介素-4，是诊断泌尿系感染的指标，然后是影像学检查对于肾盂肾炎进行常规CT检查。