尿路感染的治疗主要是注意休息，多饮水，以及足量、足疗程应用针对致病菌敏感的抗生素进行抗感染治疗。尿路感染如果反复发作，应该积极寻找病因，针对性治疗，并及时去除诱发因素。
急性期患者应该注意休息，多饮水，勤排尿。发热时给予易消化，高能量，富含维生素的饮食。要积极进行抗感染治疗。选用抗生素的原则，一是选用致病菌敏感的抗生素，二是抗生素在尿和肾内的浓度要高。三是选用肾毒性小不良反应少的抗生素。四是单一的药物治疗失败，严重的感染，混合感染，耐药菌株出现时应该联合用药。
一般治疗尿路感染需要半个月左右，但是遇到患者病情反复发作的情况，或者患者病情比较严重的时候，抗菌治疗的时间需要适当延长，一般等到症状消失，检查尿中的白细胞正常，细菌培养是(-)以后，需要再服用药物一周。如果遇到患者的疾病反复发作，可以采用长疗程的抑菌疗法，目的不是完全杀灭细菌，而是可以抑制细菌生长，让尿液中细菌数目控制在较低的水平，还不会引发复发，这些都是治疗尿路感染的原则之一。