抑郁症药物治疗时间的问题，没有绝对具体的数字界限，需要从抑郁症的复发特点以及全病程治疗原则进行了解。抑郁症复发率高达50%-85%，其中50%的患者在疾病发生后2年内复发。因此，为改善这种高复发性疾病的预后，防止复燃及复发，目前抑郁症的治疗倡导全病程治疗的原则。
全病程治疗包括急性期治疗、巩固期治疗和维持期治疗。急性期治疗时间大约8-12周，治疗目标为控制症状，尽量达到临床治愈，也就是抑郁症状完全消失，社会功能恢复良好。急性期的疗效往往决定了患者疾病的结局和预后，需要合理治疗以提高长期预后和促进社会功能康复。
巩固期治疗时间大约4-9个月，在此期间患者病情不稳定，复燃风险较大。原则上应继续使用急性期治疗有效的药物，并强调治疗方案，药物剂量、使用方法保持不变。
维持期治疗的时间尚不统一，一般倾向至少2-3年，而多次复发(3次或以上)，以及有明显残留症状的病人，建议长期维持治疗。持续规范的治疗可以有效降低抑郁症的复燃、复发率。维持治疗结束后，病情稳定者可在医生指导下缓慢减药直至终止治疗，期间一旦发现有复发的早期征象，应迅速恢复原治疗。