尿道结石症状主要有三个方面，一是排尿困难，二是疼痛，三是肿物。
首先就是排尿困难，当尿道结石嵌顿于尿道，可引起排尿困难，患者尿线变细或者尿滴沥状，有时候出现尿流中断以及尿潴留，当尿道结石完全梗阻时，则可以发生急性尿潴留。
第二个就是疼痛，排尿有时候有明显的疼痛感，且放射至阴茎头部，后尿道结石有会阴和阴囊部的疼痛，结石部位有明显的疼痛和压痛。当合并感染，则局部的疼痛加剧，尿道口有脓性的分泌物，膀胱刺激的症状，如尿频、尿急、尿痛等症状加剧。
第三个就是肿物，前尿道结石可以见于阴茎体部触及结节状的肿物，尿道外口可以见到漏出来的部分结石。此外还要注意尿道结石的伴随症状，患者可能伴有血尿和尿路感染，伴有尿路感染时，突出表现为性交痛，且尿道有脓性的分泌物排出。