耳洞发臭可能是由于打耳洞而导致的局部感染。打耳洞可能是因为外部尘埃、细菌、微生物存于耳内，从而产生臭味。此外，经常沐浴、洗头发、游泳或出汗，耳洞中都会有液体存在，处于潮湿的状态下，极易滋生细菌，尤其是真菌和厌氧细菌，因此会产生一些异味。
耳洞有臭味可能是由于局部感染，所以在打耳洞之后，一定要做好局部的清洁工作，不要吃辛辣的食物，也不要频繁地接触耳洞的局部。如果出现感染的情况，应该马上到耳鼻喉科进行看诊，进行局部的清洗、消毒、口服或者是静滴抗菌药物，有一些人经常把耳饰取下来进行定期的清洗，而并非每一天都要把耳饰取下来。耳洞要经常做一些清洁，保持干燥，避免在耳朵的内部存有一些异物，导致感染或异味，并且也会影响美观。