关于卵巢囊肿手术是否要切除卵巢，要分几个方面来综合判断，如果按患者所描述的48mm×36，如果单位也是毫米，是属于中等大小的卵巢囊肿。如果囊肿的检查提示囊肿囊壁光滑、边界清楚、没有明显血流信号，可能是生理性囊肿，或者其它良性卵巢肿瘤。
如果患者是年轻没有生育过，或者有生育需求女性，手术优先选择是卵巢囊肿的拨除，而不是切除卵巢，保留卵巢才有保留产生卵子的器官。但如果已经完成生育要求，卵巢囊肿检查提示边界不清楚、有实质性的成分、探及明显的血流信号，或是双侧的卵巢都有囊肿，对于围绝经期的女性，比如45岁以上的可以考虑做一侧卵巢的切除，对治疗效果比较确切。
总之，如果判断是良性的卵巢囊肿，是有保留卵巢的操作性，不一定非得切除卵巢；但如果是怀疑有恶性或者是良恶性无法区别，是可以考虑做卵巢切除。