多囊卵巢综合征的治疗，需要调整生活方式。对于肥胖型的多囊卵巢综合征的患者，应该控制患者的饮食、增加运动、降低体重、缩小腹围，可以增加胰岛素的敏感性，降低胰岛素和睾酮的水平，从而可以恢复排卵以及生育功能。药物的治疗主要是调整月经周期、降低血清中的雄激素水平，改善胰岛素抵抗、诱发排卵等。调整月经周期主要是定期合理地应用药物，对控制月经周期非常重要。
药物治疗的具体方案有两种：第一种，口服避孕药，也就是雌孕激素联合周期疗法。第二种，孕激素的后半周期疗法。这种方法可以调节月经，也可以保护子宫内膜。对于血清中雄激素水平过高的患者，可以用药物来降低血清中的雄激素水平。主要包括糖皮质激素、环丙孕酮、螺内酯等，改善胰岛素抵抗。对于肥胖的患者大多数会合并有胰岛素抵抗，可以使用二甲双胍来进行治疗。诱发排卵主要是针对于有生育要求的患者，在生活方式调整方面可以用来作为一种基础的治疗方法，克罗米芬是传统的一线促排卵的药物，也可以给予来曲唑等进行药物治疗。通过药物治疗能够自然怀孕的患者，一般不需要进行手术治疗。
如果患者通过药物治疗以后效果不理想，可以采用手术的方法，包括腹腔镜下卵巢 打孔术或者卵巢畸形切除手术。另外通过药物诱发排卵，仍然不能自然怀孕，或者通过手术也仍然达不到自然怀孕的情况下，也可以通过辅助生殖的技术来完成受孕。