自截肾指的是肾结核的患者整个肾脏有多个干酪的空洞发生钙化，从而导致肾功能完全丧失、输尿管完全闭塞。自截肾往往发生在肾结核的晚期。肾结核指肾脏的结核病灶，该病会出现钙盐的沉积，导致整个肾脏的广泛钙化。这个时候在超声或者CT下，就看到肾脏出现不同程度的破坏。肾功能完全丧失以后，输尿管完全闭塞，此时含有结核菌的尿液就不能够再流入膀胱，然后膀胱的继发性肾结核病变会逐渐地好转甚至痊愈。患者的尿频、尿急、尿痛等症状也会逐渐地缓解，甚至消失，患者的尿液检查也会变成正常。
肾自截是肾结核终末期的病变，这种病变一般发生于极少数的患者，因为患者的输尿管受到侵袭以后完全梗阻，整个的肾脏在肾积水、积脓的基础上，出现广泛的钙化。这个时候患者的结核菌不能进入尿液，反而会出现继发性结核好转和痊愈的情况。肾脏在腹部平片的检查时，可以看到肾脏有不同程度的钙化，CT可以看到在肾门水平有花白状，或者是弯曲充盈的肠腔样钙化，这是CT诊断肾自截的典型的特征。超声检查可以看到全肾结核的钙化，表现就是全肾有强回声的弧形的光带，后面伴有后方的声影。这是超声的特有图像。