13价肺炎疫苗第一针最晚是在出生后的第2个月接种，13价肺炎疫苗的接种对象主要是6周龄到15个月龄的婴幼儿，基础免疫时2、4、6月龄各接种1剂，首剂最早可以在6周龄时接种，之后各剂间隔4-8周时间。加强免疫是在第12-15个月龄时接种1支。接种的部位是大腿前外侧，幼儿为上臂三角肌，全程接种之后可以产生持久的免疫力，不必再接种。
肺炎球菌是引起肺炎、上呼吸道感染和菌血症、脑膜炎等各种侵袭性疾病的最常见的病因，婴幼儿和老年人发病率和死亡率都很高。肺炎链球菌有九十多种的血清型，接种13价肺炎疫苗可以预防其中的13种血清型引起的各类疾病，其中13个血清型包括1型、3型、4、5、6A、6B、7F、9V、14、18C、19A、19F和23F。