系统性红斑狼疮的标志性抗体是抗Sm抗体，抗Sm抗体的阳性率有30%左右，在其他疾病几乎不存在，是系统性红斑狼疮的标志性抗体，但是抗Sm抗体与病情是否活跃无关。除了抗Sm抗体之外，系统性红斑狼疮另外一个重要的抗体就是抗双链DNA抗体。高浓度的抗双链DNA抗体，几乎仅见于系统性红斑狼疮，所以抗双链DNA抗体，对系统性红斑来说几乎是特异性。抗双链DNA抗体的水平高低与疾病活动度直接相关，特别是与活动性狼疮性肾炎密切相关，可以用来作为系统性红斑狼疮诊断和疗效观察的一项指标。
目前临床开展的系统性红斑狼疮相关的自身抗体常规检测项目，主要有抗核抗体、抗双链DNA抗体、抗Sm抗体、抗SSA、抗SSB、抗RNP、抗核小体抗体、抗磷脂抗体。现在检测的项目很多，所以红斑狼疮的漏诊和误诊率比较低，而且在疾病的诊断和治疗过程中，会有相应的指标来监测红斑狼疮病情是否得到控制。