冻囊胚可以做三代基因筛查。一般需要将冻囊胚解冻后，把囊胚从滋养层中小心取出，再在医生指导下进行三代基因筛查。解冻后的囊胚做三代基因筛查，主要检查染色体的数目、结构是否正常以及基因问题等。
三代基因筛查的适用人群主要为高龄、反复受孕失败、反复自然流产的患者，通过对染色体进行全面筛查，筛查出异常的染色体，从而选择整倍体胚胎进行移植。通过三代基因筛查，可以筛查出125种遗传疾病，最常见的是唐氏综合征，而且还能够筛查出血球蛋白血病、肾上腺发育不良等疾病。尽可能筛出含有遗传缺陷基因的囊胚，提高胚胎移植的成功率，对于一些有先天性遗传疾病的家庭，利用三代基因筛查也能够增加健康孩子的出生概率。
患者在进行三代基因筛查时，通过能够准确地选择正常胚胎，使囊胚在子宫内的着床率大大提高，但还需定期产检，密切关注胚胎的发育情况和自身的身体状况，避免出现失误。建议患者多与医生沟通，保持乐观的心态，做好孕期的护理工作，遇到问题及时前往医院的生殖中心咨询。