做试管使用大量激素的副作用，主要是指促排药物的副作用，包含药物常见副作用，以及多胎妊娠、卵巢过度刺激综合征等疾病风险。同时，促性腺激素的使用不会增加恶性肿瘤发生率，但是对于患有性激素相关肿瘤的患者属于禁忌，如子宫内膜癌、卵巢癌、乳腺癌未治疗结束患者等。
1、促排药物副反应：如使用促性腺激素时，可以导致性激素水平增加，卵泡募集数量增加，引起食欲不振、恶心呕吐、头晕头痛，以及体重增加、精神紧张等症状。同时，由于药物促排卵可能引起卵巢增大，也可增加卵巢蒂扭转的风险，此时女性可有明显腹痛症状，需要立即就诊治疗，行手术解除卵巢扭转状态，恢复血供；
2、多胎妊娠：由于辅助生殖技术中促排卵药物具有多排卵的作用，可导致卵巢一次性募集卵泡数量增加，移植时一般选择两个或以上的受精卵，使用多胚胎移植。这类操作虽然增加妊娠的成功率，同时也增加多胎妊娠的可能，对于部分没有多胎妊娠需求的夫妻超出其预期，建议定期产检，必要时减胎治疗；
3、卵巢过度刺激综合征：促排卵药物的刺激使用，可能导致毛细血管通透性增加，引起卵巢过度刺激征，主要表现为胸闷、心悸、呼吸困难、胸腔积液等不适。处理上建议保守治疗，如补液，以调整电解质紊乱，必要时胸腔或腹腔穿刺治疗。
此外还可能是感染疾病、激素分泌紊乱导致的。临床上，辅助生殖技术没有直接增加恶性肿瘤发生率的证据，特别是短期使用的患者不会增加危险的发生率，但对于部分患者已经患有内膜癌、卵巢癌患者属于使用禁忌，对于甲状腺癌、乳腺癌患者需要专科医师评估后再考虑辅助生殖治疗。