注射宫颈癌疫苗后一般不会引起月经紊乱，注射后的不良反应主要是发烧、头晕、注射部位疼痛等。如果在注射宫颈癌疫苗后出现月经紊乱，可能与疫苗并无直接关系，建议及早进行检查，并进行针对性改善。
注射宫颈癌疫苗主要是通过刺激机体，产生HPV的相关抗体，此种抗体的产生通常与女性卵巢功能并没有直接关系，并且月经主要由卵巢分泌的雌孕激素作用于子宫内膜，而造成的子宫内膜增生、分泌以及脱落所致。注射宫颈癌疫苗并不会影响上述生理变化，因此也并不会影响月经，但也有部分患者，可能由于注射宫颈癌疫苗后精神过度紧张，担心有不适症状，从而出现月经推迟的现象，只需要放松心情，便可得到缓解。
如果之前月经周期稳定，在注射宫颈癌疫苗后出现月经紊乱，这种情况一般持续时间不长，短时间内可恢复正常。如果出现长时间月经紊乱，需要及早到医院进行检查，可能与宫颈癌疫苗并无直接关系，但与其他妇科炎症或心理因素存在一定关系。如果是由妇科炎症引起的月经紊乱，需要在医生指导下用药治疗，比如盐酸左氧氟沙星胶囊、妇炎康片等，同时需做好定期复查。