病原菌感染是指机体感染某种病原微生物引起的感染性疾病，是一个相对广泛的概念范围，主要包括细菌、真菌及病毒。
病原菌感染好发于免疫功能异常的人群，因病原菌入侵人体细胞和各个组织，产生毒素或其他物质，若此时免疫功能不全或下降，可能无法杀灭病原菌，从而引发感染性疾病。生活中存在皮肤破损未能及时处理、平时不注意个人饮食和生活卫生、与他人共用私人物品，或近距离接触他人体液会增加感染可能。
1、细菌：分布广泛，种类繁多，常见如溶血性链球菌、金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、肺炎克雷伯杆菌、结核分枝杆菌、伤寒杆菌、炭疽杆菌、志贺菌等。当人体感染上述细菌，导致体内菌群失衡，会引发一系列疾病，如感冒、中耳炎、气管炎、支气管炎、肺炎、肺结核、伤寒、细菌性痢疾等；
2、真菌：如浅表性真菌感染可引起花斑癣、掌黑癣和毛结节菌病，皮肤真菌感染可引起足癣、手癣、体癣、股癣、甲癣等，还有深部真菌感染可引起念珠菌病、曲霉病、隐球菌病等；
3、病毒：常见有呼吸道合胞病毒、流感病毒、冠状病毒等，大多数会引发呼吸道感染，还有甲肝病毒 、乙肝病毒等可引起病毒性肝炎，以及人类免疫缺陷病毒可引发艾滋病。