服用治疗双相障碍的药物会导致许多内分泌（荷尔蒙）疾病甚或使它们恶化。其他内分泌失调可能就是导致双相障碍这种疾病本身的生物学因素。在某些情况下，药物和双相障碍的生物学因素共同导致了内分泌失调。而至于双相障碍患者如何处理内分泌失调的问题，还要取决于导致其形成的主要原因。
多囊卵巢综合症（PCOS）
多囊卵巢综合征是一种内分泌失调的疾病，它会增加你患有Ⅱ型糖尿病、子宫内膜增生（子宫癌的预兆）、心脏疾病以及受孕率降低的风险。在出现多囊卵巢综合征的女性中，约有半数的女性有严重的体重问题（某些体重问题是由她们所服用的心境稳定药物所导致的）。
多囊卵巢综合征的临床症状包括卵巢上有异常囊肿、面部痤疮、男性型秃头、汗毛生长过盛、体重增加、睾丸激素过高等。这种疾病可以通过排卵频率降低、雄激素过多症（睾丸激素等雄性类固醇水平上升或对它的敏感性上升）、胰岛素抵抗、不孕症等症状来进行诊断。卵巢上的异常囊肿可以通过超声波仪器来检测，而雄性激素过多症一般通过性类固醇（如睾丸激素）和生殖激素（如雌激素或孕酮）的验血来进行检测。
在你开始服用任何新的心境稳定药物后，要密切关注月经不规律或体重显著增加的迹象。在一般人口中，5%的女性会患有多囊卵巢综合征，然而，如果你服用某心境稳定剂类的药物（双丙戊酸钠）的话，那么你患多囊卵巢综合症的风险就会增加。尽管多囊卵巢综合征与双相障碍或许有相同的遗传基础，但是此心境稳定剂药物会显著增加你患有前一种疾病（多囊卵巢综合征）的风险。
在患有双相障碍的女性中，头一年服用某心境稳定剂类的药物（双丙戊酸钠）的患者有10. 5%出现月经不规律的情况和雄性激素过多症，而服用抗惊厥药的患者只有1-4%出现同样症状。当女性患者停止服用某心境稳定剂（双丙戊酸钠）后，她们的月经周期得到改善，而睾丸激素的水平也随之降低。
然而，当你服用某心境稳定剂（双丙戊酸钠）并出现月经不规律的状况时，不要以为你就是患有了多囊卵巢综合征。月经不规律也可能预示着意外怀孕、催乳激素水平上升、压力或更年期的开始。
当你服用了治疗双相障碍的药物，并且出现了月经不规律、体重猛增、汗毛增生或出现了其他生殖性疾病的迹象，那么必要时需要医生来检查你的雄性激素水平，或通过超声波仪器来检查你的卵巢是否有多囊性变化。如果真的出现上述症状，那么你极可能需要在医生的指导下停止服用此类抗惊厥药物，并换服其他心境稳定剂。
催乳激素水平上升
催乳激素水平上升（高催乳素血症）会危及患者的健康，因为它会增加患乳腺癌的风险，并且还会导致月经频次减少，当你的月经频次降低时，会导致雌性激素的产量过少，雌性激素水平过低会反过来又会导致不孕，降低骨质密度，从而给你带来患有骨质疏松症的风险。
另外，当催乳激素水平上升时，还会导致乳溢症（非正常泌乳）、乳房增生、闭经、偏头痛或性欲减退等。
如果你的药物治疗包括某些抗精神病药物的话，那么你患有高催乳素血症的风险会更高。在服用某些抗精神病药物（利培酮）的患者中，有48%至88%的女性会出现高催乳素血症。因此，如果你有乳腺癌家族史，那么你在服用此类药物时，检查你的催乳激素水平就显得尤为重要。
如果你的催乳激素水平上升，但并未出现月经不规律的迹象，就不需要对它进行治疗。但是，如果你有高催乳素血症活跃的症状，那么你可能需要停止服用抗精神病药物，而换服一种不太可能导致催乳激素上升的药物。如果医生检查出你的雌性激素水平过低而催乳激素水平过高，那么可能会建议你服用一种可以提升雌性激素水平的荷尔蒙避孕药。
体重增加与代谢综合征
尽管双相障碍的男性和女性患者出现肥胖症的风险都会增加，但是女性患者的风险更高。肥胖症一般被界定为BMI为30；体重超标则一般被界定为BMI至少有25。如果你在服用精神病药物之前，就为体重超标的问题烦恼，那么，服用此类药物无疑将会“雪上加霜”。
体重增加和肥胖症一个特别令人担忧的影响就是代谢综合征，它是由胰岛素抵抗或葡萄糖耐受不良（身体无法正常利用胰岛素或血糖）、高血糖症（血糖过高）、腹部脂肪组织过多、血脂异常（一般由甘油三酯偏高、高密度脂蛋白偏低、低密度脂蛋白胆固醇偏高来表明）、高血压等症状构成。代谢综合征会影响16.7%至49%的双相障碍患者，并且与一般的体重问题那样，对女性患者的影响更大。肥胖症和代谢综合征是包括糖尿病、高血压、心血管疾病在内的严重健康问题的危险因素。
为了避免患上代谢综合征，你能做的第一件事就是弄清楚特定药物对体重增加的影响。如不管你服用的是非典型抗精神病药物或其他药物，必要时医生可以通过检查你的胆固醇和甘油三酯的水平，进行空腹血清胰岛素检验或葡萄糖耐受性检验、血脂分析等来判断你是否患有代谢综合征。
如果你在服用了抗精神病类药物后岀现了不良身体反应，如体重开始明显增加，应尽快在医生的指导下更换其他的治疗方案。如调整你所服用药物的剂量；在一天中的不同时段服药；换服那种体重增加风险更低的药物等。
当然，如果你的体重增加，绝大多数医生会建议你坚持锻炼并保持健康的饮食习惯。但是当你陷入抑郁状态时，你会非常难以做到，从而导致对自己更加失望。如果你没有按照计划坚持锻炼或保持健康的饮食习惯，也尽量不要对自己过于苛刻。当你的心境得到改善时，你或许就能够恢复此类健康的生活方式。
甲状腺机能障碍
抑郁症似乎比其他类型的精神疾病更容易导致甲状腺机能障碍，尤其是甲状腺荷尔蒙产量过低或甲状腺机能减退症。与男性患者相比，女性患者出现甲状腺机能减退症的几率更高。女性患者首次出现甲状腺机能障碍的时间不一，有的是在月经初潮前后岀现，有的是在分娩 之后出现，有的则是随着正常衰老而出现。甲状腺机能障碍的致病因素有很多，如自身免疫性疾病、碘缺乏病、遗传以及某些药物。
有某些证据表明，快速循环与甲状腺机能减退（二者在女性患者中更为常见）有关。某些抗精神病类药物（锂盐）抑制了某些患者的甲状腺荷尔蒙水平，从而导致其甲状腺机能减退。因此，医生通常会把检查甲状腺水平作为血液常规检查的一部分，尤其是当你开始服用新药时。
如果你出现了甲状腺机能减退症状，那么你可能就需要服用甲状腺补充物。由于甲状腺补充物会降低抑郁症发作的频率，所以，你也未必是在出现甲状腺机能减退症状后才开始服用它。
但是，如果你开始服用甲状腺补充物，就要对甲状腺机能亢进症保持警惕，因为这会使你出现心房颤动或骨质疏松症的风险。甲状腺机能亢进的症状一般多表现为：月经周期改变、感到火热或流汗、心悸、体重或胃口变化、焦虑、经常拉肚子或排便等。医生也可以通过采用标准的血液检验来判断你是否出现了甲状腺机能亢进。
如果你出现了甲状腺机能亢进症状，可以在医生的指导下停止服用甲状腺补充物或改服其他补充物。
偏头痛
偏头痛与心境障碍或焦虑症（尤其是恐慌症）存在明显的关联。一项最近的研究表明，有偏头痛的女性患有双相障碍的比例是没有偏头痛女性的四倍，并且前者患有抑郁症的比例是后者的两倍。尽管男性患者也会出现偏头痛，但是女性患者出现偏头痛的比例至少是男性患者的两倍。
女孩一般在月经初潮前后出现偏头痛，并会在月经前期或月经期间重复出现这种症状。偏头痛通常要比普通的头痛糟糕得多，患者一般从早上开始感到头痛，至少持续四个小时；且只在头部的某一侧出现疼痛的感觉，使患者头部有一跳一跳的感觉；身体活动会使偏头痛加剧；一旦出现偏头痛，患者经常需要卧床休息才能得以缓解。
患者在使用治疗偏头痛的药物时，要注意尽量避免服用会增加泌乳素水平的药物。
尽管某些抗精神病类药物也可以改善偏头痛的状况，但是其并非是治疗偏头痛的首选。如果女性在患有双相障碍的同时，还患有偏头痛，那么，在进行药物治疗时，应及时告知医生，并与之确认药物对你的心境的影响以及它们与你所服用的心境稳定剂之间潜在的药物相互作用。
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