眼睛真菌感染患者需及时到医院的眼科完善常规检查、裂隙灯检查，可遵医嘱通过一般治疗、药物治疗、手术治疗等方式治疗。眼睛真菌感染常见于烟曲霉菌或白色念珠菌等真菌感染，真菌在侵入眼部后会导致眼部组织出现炎性病变，可能会引发结膜炎、角膜炎等疾病。
1、一般治疗：眼睛真菌感染严重的患者需要注意眼部的护理，尽量避免用手揉擦眼部，注意保持眼睛周围的清洁。此外对于佩戴眼镜的患者需要立即停止佩戴隐形眼镜，避免加重感染，影响病情治疗及恢复；
2、药物治疗：眼睛真菌感染严重的患者需及时选择药物进行治疗，可遵医嘱使用氟康唑滴眼液、那他霉素滴眼液等抗真菌的药物进行治疗，将药物直接滴入眼睑内，起到抗真菌作用，帮助患者缓解眼部不适症状。此外还可遵医嘱配合口服抗真菌的药物进行治疗，如氟康唑片、盐酸特比萘芬片、伊曲康唑胶囊等；
3、手术治疗：对于眼睛真菌感染导致角膜溃疡，甚至是角膜穿孔的情况的患者，还需在医生的指导下采用结膜瓣遮盖手术、全层角膜移植术等手术方法来进行治疗。
眼睛真菌感染常见于其他组织有炎症病灶蔓延至眼部 ，及接触感染导致，患者可表现为眼部充血，并伴随有黏液及脓性分泌物。