腺样囊性癌是上皮来源恶性肿瘤，恶性程度较高，容易发生局部浸润，并且对放化疗都不是很敏感，发生、发展也比较快。早期即可出现局部侵袭以及远处转移，总体预后并不是很好。
目前以手术为主的综合序列治疗仍然是腺样囊性癌的主要治疗手段，手术设计时应扩大手术正常边界，对于局部肿瘤及部分周围正常组织的广泛切除是根治腺样囊性癌的主要原则。复发性或晚期肿瘤除做广泛切除外，可配合放射治疗，有些解剖部位不能彻底治疗时，也需要术后配合放射治疗，放射治疗有可能减低复发几率。对于失去手术机会的病例，也可以采用放射治疗控制发展、延长病程。