红斑狼疮是一种典型的自身免疫性结缔组织病，发病原因比较复杂，与遗传呈一定的相关性。已经发现有50多个基因位点与红斑狼疮发病有密切关系。有一部分患者有家族聚集倾向，其家庭中有一部分人也患有红斑狼疮，或者其他结缔组织病，所以基因遗传在红斑狼疮的发病中占有很重要的地位。
但不是携带易感基因就一定会患红斑狼疮，后天因素也很重要，包括内分泌，特别是性激素，与红斑狼疮的发病有密切关系，环境、药物等也与红斑狼疮的发病有关。所以红斑狼疮的发病与携带易感基因有关，但它为遗传因素和后天环境因素两者长期共同作用的结果，而不是遗传病。