食管癌粒子支架存在一定的危害，主要是在于粒子的放射性，该放射性可能会持续比较长的一段时间，这是在粒子支架具有治疗作用之外的一种副作用。这种副作用可能会对机体的其它组织器官以及自己周身的环境，或者家人、同病房的其它病人，都存在一定的放射性，但是放射性一般控制在一定的范围之内。
在做完支架之后，有的医院会进行铅毯的覆盖，防止该类放射性物质过多释放到周围环境中，或者对家人造成其它方面的损害。一般放置粒子支架以后会让病人单独在一个房间里，减少对其它病人的损害。一般一周左右放射物质最高峰的放射值会相对减少，所以不用过于担心粒子支架造成比较长久的伤害，它主要还是起到治疗作用。