拉肚子在医学上是指腹泻，一般正常饮用咖啡不会造成腹泻，一旦出现腹泻，考虑可能为咖啡变质、饮用方法不当、咖啡过敏、乳糖不耐受和肠易激综合征等情况的可能。
1、咖啡变质：饮用咖啡的质量可以直接影响饮用后人体的情况，变质过期或者质量不好的咖啡可能会含有细菌等冰原微生物，饮用后可能会导致肠胃不适，引发腹泻。因此应选择正规厂家出品的咖啡，并注意在饮用前观察其保质期。
2、饮用方法不当：咖啡属于刺激性的饮品，一次性或者过快喝了太多咖啡可能会刺激肠胃，另外，咖啡中加入太多冰块也会刺激肠胃。因此，喝咖啡时尽量缓慢饮用，同时胃肠功能较差的人群应注意尽量避免喝冰咖啡。
3、咖啡过敏：有部分人的过敏原可能为咖啡或者咖啡中的某些成分，一旦饮入咖啡会产生过敏反应，引起腹泻，还可能会伴有皮疹、发热等症状。出现还是那个书情况后，应前往医院就诊，查明过敏原，此后避免再次饮用咖啡。
4、乳糖不耐受：有些人偏好在咖啡中加入牛奶或者奶油以改善口感，但如果本身存在乳糖不耐受，肠胃不能摄入乳糖，就会引发腹泻，因此应注意在喝咖啡时避免加入乳制品。
5、肠易激综合征：存在肠易激综合征的情况时，在焦虑、精神紧张或者其他因素刺激时，刺激肠道产生痉挛，造成腹痛腹泻。应注意调整自身情绪，可通过听舒缓音乐、适当缓慢运动等方式缓解自身焦虑和压力，如果腹泻情况严重，还需遵医嘱应用蒙脱石散、匹维溴铵片等药物缓解腹泻症状。
除上述情况外，还有存在腹部受凉、菌群失调、胃肠功能紊乱、胃肠炎、胃溃疡、胃肠痉挛、消化系统肿瘤等疾病的可能性，如果腹泻情况一直存在未能缓解，应及时前往医院消化内科就诊，明确自身情况后积极进行相应治疗。