所谓子宫内膜异位症，是指具有正常功能的子宫内膜的腺体以及间质出现在宫腔以外的其他地方。根据其发生的部位，主要的表现形式有两种：第一种是卵巢巧克力囊肿：第二种是子宫腺肌病。卵巢巧克力囊肿对身体的危害主要有以下三点，第一点是痛经，第二点是盆腔包块，第三点会引起不孕症。
首先，痛经。卵巢巧克力囊肿导致的痛经非常严重，甚至影响正常的生活。在月经前期即会出现下腹坠胀不适的感觉，持续整个月经期，有些甚至非月经期也会出现下腹部的疼痛不适的感觉，尤其是在同房或者行妇科检查时可以明显的感觉到触痛。
其次，盆腔包块。卵巢巧克力囊肿随着时间的延长，盆腔会出现巧克力样的液体，加之周围组织的包裹，从而形成包块，包块大于4cm，或者伴有卵巢肿瘤标志物的升高，有手术探查的指征。
最后，不孕。由于卵巢巧克力囊肿组织的粘连与周围组织的侵蚀作用，会导致输卵管的不通畅或者通而不畅，从而影响怀孕。