霉菌性包皮炎，是由于一种真菌性感染所导致的炎症。所以临床上先要使用抗真菌药物外用治疗，比如可以使用酮康唑软膏进行局部治疗。霉菌性包皮炎往往见于抵抗力较差的包茎，或者包皮过长的患者，所以对于有包皮过长或者包茎的患者，在炎症得到控制的时候，建议去做包皮环切手术，可以使得龟头外露，从而更好保持龟头的清洁、干燥，以减少出现霉菌性包皮炎的机会。
同时，如果男性有霉菌性感染，通过性接触可能会导致女性也出现霉菌性的阴道炎，会造成夫妻之间的交叉感染，所以对于有霉菌性包皮炎的男性患者，建议性伴侣同时也要去医院检查一下，是否存在有霉菌性的阴道炎，夫妻双方的同时治疗，可以避免之后出现反复的交叉感染。