龟头炎依据病因可分为：
1、细菌性龟头炎，多由细菌感染引起。表现为龟头疼痛、表面糜烂、分泌物增多等症状，伴排尿异常。常常有机体免疫力下降，或者接触到的细菌数目增多，而导致细菌感染引起，治疗需要进行抗感染治疗。
2、真菌性龟头炎，大多由真菌感染引起，真菌属于机会菌感染。正常情况下不会造成人体致病状态，但包皮过长或者包茎患者，局部存在慢性缺氧，或者长期慢性感染、刺激等因素存在，可继发引起真菌感染。真菌感染后可形成表面有菌膜、菌丝等症状。需要进行外洗，并抗真菌治疗才能达到彻底治愈的效果。
3、滴虫感染，多见于女方滴虫感染性阴道炎后，通过性接触传播而导致男方出现滴虫性龟头炎。治疗需要双方共同治疗，口服或者使用静脉输注抗滴虫的药物，才能达到彻底治愈的效果。