X线钡餐检查的禁忌证包括绝对禁忌证、相对禁忌证两方面，检查前需要先咨询医生，在医生指导下选择合适检查方式，减少对身体的损伤。
1、绝对禁忌证：消化道存在完全性梗阻或穿孔，或是在消化道大出血期间，或存在抗胆碱药禁忌证，或是有全身严重衰竭而不能耐受检查的人群，均绝对禁忌进行X线钡餐检查，否则可能会对胃肠黏膜造成刺激，使得病情进一步加重，反而不利于后续治疗。这类人群可以先选择大便常规、腹部B超等检查，并结合症状、体征等，以判断病因；
2、相对禁忌证：如果受检查者消化道有不完全梗阻或狭窄，或是有可以穿孔，或是存在消化道活动性出血，或是近2周内有消化道大量出血等情况，暂时也不能做X线钡餐检查，也可能会造成明显刺激而加重病情。这类人群病情稳定并经医生评估后，才可以遵医嘱做X线钡餐检查。
除此以外，如果本身对这类检查过于恐惧，且能够用其他检查进行代替的，也可以在咨询医生后调整检查方案。检查前建议咨询体检科、消化内科等科室医生，注意空腹，并暂时停用会影响检查的药物，以免影响检查结果。