女性的导尿需要进行充分的消毒，因为女性的尿道陡直，容易继发细菌的逆行感染，因此在消毒当中需要有一定的步骤和顺序。
医师应该佩戴手套，同时应用钳子、钳夹、碘伏、棉球，进行初步的外阴消毒，消毒顺序依次为耻骨上区、阴阜、大阴唇、小阴唇，消毒的方向为从外到内，由上到下。先消毒大阴唇，再消毒小阴唇，消毒的方向是以顺时针同心圆方向，逐渐由外到内进行消毒，每次消毒过后，棉球都要抛弃，然后再换新的棉球进行消毒。在首次消毒之后，还要进行二次的消毒，一般消毒应该三遍，消毒过后应该打开导尿包，润滑导尿管，可以进行石蜡棉球在导尿管的前端进行润滑，然后进入尿道口，留置气囊可以完成导尿。