心脏神经官能症主要采取双心模式进行治疗，从心脏和心理双重角度给予关注与疏导。心理治疗主要是解除患者的思想顾虑，让其自己相信没有器质性心血管疾病。
其次鼓励患者多参加集体活动，进行体育锻炼和自我调整心态，适当进行文娱和旅游。通过心理疏导不能达到良好的效果，可以给予药物治疗。常用的药物有氟哌噻吨美利曲辛片、盐酸舍曲林片、盐酸氟西汀分散片等。如果有明显的心慌症状，心率快可以给予β受体阻滞剂，如美托洛尔、比索洛尔等缓解症状。
绝经期前后的女性引起神经官能症的原因，可能是体内雌激素水平下降所致，可以适当补充雌激素。