胰腺假性囊肿会不会自然吸收要看大小，对于胰腺假性囊肿，5cm以下有可能会完全吸收；＞5cm以上胰腺假性囊肿，理论上认为吸收很困难。对于5cm以下胰腺假性囊肿，若吸收不了或者在短期内吸收不了，其又与胰腺主胰管相通，可通过ERCP的方法放置胰管支架，有可能在短期之内囊肿会消失。因为囊和主胰管相通，胰管支架放到主胰管里，囊液就会通过胰管支架排到胃肠道里。如果没有症状，可以不做处理，定期观察即可。
大的胰腺囊肿，有可能会有很多症状，比方说压迫胆管造成阻塞性黄疸或者囊肿很大占据半个腹腔，造成病人饮食和呼吸障碍。甚至压迫胸腔，造成病人呼吸困难，这种情况就要及时处理。外科手术处理做囊肿和胃或者空肠吻合；可内镜下处理做胃囊肿穿刺，放置支架；B超下处理，经过体表穿刺来释放囊液，切除囊内坏死组织，使得囊肿愈合和吸收速度加快。